Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhoaQ9QUI0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms