Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms