Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms