Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.1 ms