Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms