Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AatfQ9JKX4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AatfQ9JKX4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms