Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms