Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms