Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms