Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms