Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ybx3Q9JKB3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms