Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms