Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms