Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smco4Q9JIS3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms