Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc6l2Q9JIM3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms