Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lgi1Q9JIA1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lgi1Q9JIA1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms