Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pus3Q9JI38 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms