Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms