Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cldn19Q9ET38 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn19Q9ET38 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms