Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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