Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms