Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms