Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn12Q9ER56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms