Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms