Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms