Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rhox9Q9EQM5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rhox9Q9EQM5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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