Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms