Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r56Q9EPS9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms