Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms