Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms