Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt112Q9DCG9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms