Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms