Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgf29Q9DA08 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms