Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms