Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmco5aQ9D9D5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms