Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D979 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D979 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D979 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D979 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D979 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D979 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms