Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms