Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms