Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slx4ipQ9D7Y9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms