Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms