Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13Q9D777 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms