Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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