Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms