Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms