Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms