Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3404Q9D506 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3404Q9D506 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms