Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms