Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph14Q9D3W1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms