Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D2Q3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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