Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms